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基因芯片识别变异空间错误

发布时间:2019-02-08 06:16:03来源:未知点击:

作者:Anil Ananthaswamy在长途太空飞行中,通常无害的细菌可能以不可预见的方式发生变异并威胁到机组人员的健康或生命支持系统 - 因此美国宇航局正在开发一种“基因芯片”来识别这种威胁性微生物航天器上发现的大多数细菌都被船员带上了在扩展任务中,船员将不得不种植植物并回收废物,水和空气,提供独特的生态环境,使虫子繁衍生息在地球上,导致疾病或其他问题的物种往往是众所周知的,并且以熟悉的方式表现但是在近零重力和增加辐射的外来条件下,鲜为人知的虫子可能变得有毒,甚至熟悉的物种也会开始表现不同,例如堵塞空气过滤器或水净化系统有证据支持这种担忧模拟微重力实验表明沙门氏菌变得更具毒性德克萨斯州休斯顿大学的George Fox和他的团队发现微重力引起大肠杆菌细菌基因表达的变化 “如果[微生物]出于某种原因导致问题,我们需要有一种机制来弄清楚它是什么,”他说可以使用探针DNA序列鉴定细菌,所述探针DNA序列各自仅结合特定物种但是不可能为每种可能发生变异的细菌携带探针所以福克斯和他的同事理查德威尔森已经开发出一种快速识别神秘虫属于哪一组微生物的方法他们不是看DNA,而是看细菌核糖体RNA的一部分这些区域变化很大,相关细菌群具有独特的特征序列研究人员正在构建一种芯片,该芯片将包含4000种RNA探针,经过精心挑选,可覆盖多种细菌虽然芯片无法确定精确的有机体,但如果一个神秘的微生物的签名与任何一个探测器匹配,宇航员将大致知道它们的反对意义 “它没有单目标探针的肯定答案,”威尔森说但它几乎总是提供至少一些信息 - 例如,建议哪些抗生素可能有效休斯敦美国宇航局约翰逊航天中心微生物学主任杜安皮尔森对此表示赞同他说,虽然太空中的细菌感染到目前为止还没有给宇航员带来任何重大问题,但他们仍然担心 “如果你要去火星,你不想让某人回来因为某种感染,如果我们对它有更多了解就可以预防,”他说 “这项技术可能非常有价值”基因芯片也可以帮助地球例如,在前线生物防御中,它可以快速识别信封中的可疑粉末是微生物还是糖在传染病的情况下,如果临床医生无法识别确切的生物体,尽管患者有明显的感染迹象,但芯片至少可以缩小范围 “这是一种了解令人费解的案例的方法,